學(xué)術(shù)報告Ⅰ：Packaging Nucleic Acids with ions, force, and nanotubes
主講人：邱祥云
時間： 2017年6月28日下午14:00-15:30
地點： 南湖校區(qū)東配樓5樓，數(shù)學(xué)與計算機學(xué)院教工之家
摘要: Biological functions of biomolecules are closely connected with their structures and the forces animating such structures. Physical understanding of biomolecular force and structure is thus critical to unraveling their biological roles. We have a long-standing interest in how the force/structure-function relationships are manifested in the increasingly diverse lands of nucleic acids, whose biological roles are well beyond being the carrier of genetic information. In this talk, I will introduce our primary experimental technique of x-ray scattering and how it is used to measure nucleic acids force and structure, specifically in systems ranging from bare DNA in a test tube to tightly packaged genome in viruses and to the artificial system of DNA and carbon nanotube hybrids.
主講人簡介：1999年本科畢業(yè)于中國科技大學(xué)，并于Michigan State University攻讀博士學(xué)位。此后，分別在Cornell University和Lab of Physics & Structural Biology of NIH 從事生物物理相關(guān)研究。于2010年加入George Washington University物理系任教至今。主要研究方向：應(yīng)用物理實驗手段研究生物大分子的結(jié)構(gòu)、功能和動力學(xué)，及超分子的組裝等。
學(xué)術(shù)報告Ⅱ：RNA動力學(xué)與RNA調(diào)控
主講人：張文炳
時間： 2017年6月28日下午15:30-16:30
地點： 南湖校區(qū)東配樓5樓，數(shù)學(xué)與計算機學(xué)院教工之家
摘要：RNA對基因的調(diào)控與RNA動力學(xué)有關(guān)。如配體與核糖開關(guān)單元結(jié)合會引起表達(dá)單元發(fā)生構(gòu)象變化，從而調(diào)控基因表達(dá)或翻譯過程，實驗上發(fā)現(xiàn)一部分核糖開關(guān)依賴于轉(zhuǎn)錄速率和代謝物與之相結(jié)合的動力學(xué)，其對基因的調(diào)控由其轉(zhuǎn)錄速率、折疊速率、配體濃度及與配體結(jié)合的速率決定；RNAi分子和細(xì)胞中的蛋白組裝成RISC，RISC在RNAi的引導(dǎo)下完成與特定靶目標(biāo)RNA的識別和結(jié)合，達(dá)到抑制靶目標(biāo)基因表達(dá)的效果, RNAi的有效性也與其和靶目標(biāo)的結(jié)合動力學(xué)有關(guān)。我們對單個堿基對的研究表明：形成配對速率的溫度依賴性弱，其勢壘為熵變，打開速率則強烈依賴于溫度，其勢壘為焓變。擴散系數(shù)呈現(xiàn)出super-Arrheinus行為。據(jù)此我們發(fā)展了RNA轉(zhuǎn)錄過程中折疊的動力學(xué)方法來預(yù)測RNA轉(zhuǎn)錄過程中結(jié)構(gòu)的變化，用來研究RNA結(jié)構(gòu)變化對基因的調(diào)控；我們發(fā)展RNA與靶目標(biāo)結(jié)合的動力學(xué)可用來預(yù)測siRNA的有效性及miRNA靶目標(biāo)。
主講人簡介：張文炳，武漢大學(xué)物理科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授，博士生導(dǎo)師。1999年獲得武漢大學(xué)博士學(xué)位，并留校任教，2000年晉升為副教授。1999.11至2005.12，公派前往美國密蘇里-哥倫比亞大學(xué)物理系做研究工作， 2005年12月回武漢大學(xué)，晉升為正教授，并被遴選為博士生導(dǎo)師。2006年入選教育部新世紀(jì)人才計劃，2010年獲國家自然科學(xué)二等獎（第四完成人）。目前主持多項國家自然科學(xué)基金.主要研究方向為生物大分子的統(tǒng)計熱力學(xué)、RNA折疊動力學(xué)、生物分子間的相互作用及單分子生物物理等。
學(xué)術(shù)報告Ⅲ：Modeling & simulations for RNA structure, stability, flexibility and ion electrostatics
主講人：譚志杰
時間： 2017年6月28日下午16:30-17:30
地點： 南湖校區(qū)東配樓5樓，數(shù)學(xué)與計算機學(xué)院教工之家
摘要：RNA作為一類重要的生物大分子，其在生物體內(nèi)發(fā)揮著各種重要的功能，并且其諸多功能表達(dá)的異常往往伴隨著疾病的發(fā)生。RNA這些功能的表達(dá)需依賴其特定的空間結(jié)構(gòu)以及結(jié)構(gòu)變化。因此，了解RNA的空間結(jié)構(gòu)及其穩(wěn)定性不僅有助于理解RNA的各種功能，而且還可以進(jìn)一步指導(dǎo)一些相關(guān)應(yīng)用，如藥物設(shè)計、RNA納米等。本學(xué)術(shù)報告將系統(tǒng)地講述如何通過物理建模并利用分子動力學(xué)模擬研究RNA分子的結(jié)構(gòu)以及穩(wěn)定性和柔性等結(jié)構(gòu)特性，并且還將就溶液中的離子（比如Na+、Mg2+離子）對RNA結(jié)構(gòu)及穩(wěn)定性的影響做詳盡的討論。
主講人簡介：譚志杰，武漢大學(xué)物理科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授，博士生導(dǎo)師。1996年武漢大學(xué)理學(xué)學(xué)士；2001年獲得武漢大學(xué)理學(xué)博士學(xué)位；并留武漢大學(xué)任教，于當(dāng)年底破格晉升為副教授。后公派赴美國密蘇里大學(xué)合作研究，并獲得該校生命科學(xué)博士后專項獎學(xué)金。2008回武漢大學(xué)并晉升為教授且遴選為博士生導(dǎo)師。2003年獲全國優(yōu)秀博士論文提名，2009年入選教育部新世紀(jì)優(yōu)秀人才計劃，2010年獲自然科學(xué)二等獎（排名三），2011年獲湖北省青年科技獎。主要研究興趣為核酸結(jié)構(gòu)、熱力學(xué)和靜電學(xué)的理論建模和模擬。
